「Background Questions」内の犯罪歴に関する質問で「Yes」を選択すると、その下に詳細を入力するフォームが表示されますので、詳細を入力し、そのまま申請を完了してください。
申請完了後、それを証明する書類など、必要であれば移民局より追加書類の提出要請のメッセージが来ますので、それに従って取得、提出する流れとなります。
最終的には各自の判断になるかと思いますが、起訴されていない(有罪または前科になっていない)ようなケースであれば「No」にしておいても問題ないと思いますが、嘘をつくのが心配だと思われる場合は、正直に「Yes」としてその内容を書いていただくのが一番確実だと思います。
仮に Yesとしたからといって申請が却下されるわけではありませんし、追加書類を要求されるとも限りません。